Для боротьби з різними монстрами треба створювати особливу армію, тому в грі Level Up Mutants ви займетеся селекцією різних мутантів. Перед вами на екрані видно шлях, яким біжить ваш герой. Керуючи його бігом, ви оббігаєте різні перешкоди та пастки. Якщо ви помітили предмети на дорозі, підніміть їх. Також управляє персонажем за допомогою зелених силових полів. Це змінить вашого персонажа та зробить його мутантом. Наприкінці шляху на вас чекає монстр, щоб битися з вашим мутантом. Перемога над монстрами приносить вам окуляри у Level Up Mutants.